| Ders Kodu | Ders Adı | Teorik | Uygulama | Laboratuvar | Yerel Kredi | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TB5061 | BİTKİ ISLAHINDA MOLEKÜLER MARKÖR TEKNİKLERİNİN KULLANIMI | 3,00 | 0,00 | 0,00 | 3,00 | 8,00 |
| Dersin Dili | : | Türkçe |
|---|---|---|
| Dersin Seviyesi | : | Yüksek Lisans |
| Dersin Tipi | : | Seçmeli |
| Ön Koşullar | : | Yok |
| Dersin Amacı | : | Bu dersin amacı, moleküler markörlerdeki son gelişmeler ve bunların bitki ıslahındaki uygulamaları hakkında temel ve kapsamlı bilgileri sağlamaktır. |
| Dersin İçeriği | : | Moleküler genetik laboratuarlarının kullanımı, tampon ve stok çözeltilerin hazırlanışları ile kullanımları, bitkilerde DNA izolasyonu, PCR kullanımı ve uygulamaları, DNA miktarı ve kalitesinin belirlenmesi, Jel elektroforez sistemleri, allel büyüklerinin tanımlanması, DNA dizisinin belirlenmesi, cDNA kütüphanelerinin oluşturulması gibi konular işlenmektedir. Ayrıca, bu derste moleküler markör sistemlerinin (RFLP, AFLP, SSR, SCAR vb.) tanımı ve detaylı açıklamaları ile bu markörlerin bitki ıslahı çalışmalarında ve özellikle markör yardımıyla seleksiyon yönteminin gerek tek gen ve gerekse çoklu gen (kantitatif) tarafından belirlenen agronomik özelliklerin ıslahı uygulamalarında kullanımı konularında detaylı bilgiler verilecektir. |
| Dersin Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar | : | 1. Molecular markers and marker-assisted breeding in plants. In: Andersen SB, editor. Plant breeding from laboratories to fields. Rijeka: InTech; 2013. p. 45–83. 2. Molecular Marker Applications in Plants. In: Batley J. (eds) Plant Genotyping. Methods in Molecular Biology (Methods and Protocols), vol 1245. Humana Press, New York, NY. 3. http://sci-hub.tw/10.1007/978-1-4939-1966-6_2 4. http://sci-hub.tw/10.5772/52583 5. https://doi.org/10.1080/13102818.2017.1400401 |
| Planlanan Öğrenme Etkinlikleri ve Öğretme Yöntemleri | : | Powerpoint sunum, araştıma makaleleri, tartışma |
| Ders İçin Önerilen Diğer Hususlar | : | Bilimsel makaleler |
| Dersi Veren Öğretim Elemanları | : | Doç. Dr. Muhammad Azhar Nadeem |
| Dersi Veren Öğretim Elemanı Yardımcıları | : | yok |
| Dersin Verilişi | : | Yüz yüze eğitim ve Tartışması, online eğitim |
| En Son Güncelleme Tarihi: | : |
| Ders Kodu | Ders Adı | Teorik | Uygulama | Laboratuvar | Yerel Kredi | AKTS |
|---|
| Teorik | Uygulama | Laboratuvar | Hazırlık Bilgileri | Öğretim Metodları | |
|---|---|---|---|---|---|
| 1.Hafta | *Moleküler markörlere giriş |
||||
| 2.Hafta | *Moleküler markör türleri |
*Moleküler markör türleri |
*DNA izolasyonu |
||
| 3.Hafta | *Moleküler markör türleri |
*Morfolojik markörler |
*DNA izolasyonu |
||
| 4.Hafta | *Sitolojik markörler ve Biyokimyasal markörler |
||||
| 5.Hafta | *Moleküler markörler / DNA markörleri ve sınıflandırılmaları |
*Jel elektroforezi |
|||
| 6.Hafta | *Hibridizasyon tabanlı markörler (RFLP) |
||||
| 7.Hafta | *Ara sınav |
*PCR kullanımı ve uygulamaları |
*PCR kullanımı ve uygulamaları |
||
| 8.Hafta | *PCR tabanlı markörler ve PCR primerleri |
*PCR tabanlı markörler ve PCR primerleri |
|||
| 9.Hafta | *RAPD ve AFLP markörleri |
||||
| 10.Hafta | *ISSR ve SSR markörleri |
*ISSR ve SSR markörleri |
|||
| 11.Hafta | *Retrotranspozonlar ve Sekans tabanlı markörler |
*Retrotranspozonlar ve Sekans tabanlı markörler |
|||
| 12.Hafta | *Bitki bilimlerinde moleküler markörlerin kullanımı |
||||
| 13.Hafta | *GWAS ve QTL haritalama |
||||
| 14.Hafta | *Final sınavı |
| Aktiviteler | Sayı | Süresi(Saat) | Toplam İş Yükü |
|---|---|---|---|
| Final / Final | 1 | 14,00 | 14,00 |
| Ödev / Assignment | 1 | 15,00 | 15,00 |
| Seminer / Seminar | 1 | 25,00 | 25,00 |
| Teorik Ders Anlatım / Theoretical Lecturing | 14 | 3,00 | 42,00 |
| Final Sınavı Hazırlık / Preparation for final | 1 | 30,00 | 30,00 |
| Proje / Project | 1 | 20,00 | 20,00 |
| Ders Öncesi Biresysel Çalışma / Individual study before lecture | 14 | 5,00 | 70,00 |
| Vize / Midterms | 1 | 20,00 | 20,00 |
| Toplam : | 236,00 | ||
| Toplam İş Yükü / 30 ( Saat ) : | 8 | ||
| AKTS : | 8,00 | ||
| P.Ç. 1 | P.Ç. 2 | P.Ç. 3 | P.Ç. 4 | P.Ç. 5 | P.Ç. 6 | P.Ç. 7 | P.Ç. 8 | P.Ç. 9 | P.Ç. 10 | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ö.Ç. 1 | 4 | 4 | 3 | 3 | 4 | 3 | 4 | 5 | 3 | 3 |
| Ö.Ç. 2 | 4 | 3 | 3 | 3 | 4 | 3 | 4 | 4 | 4 | 3 |
| Ö.Ç. 3 | 3 | 4 | 2 | 4 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 |
| Ö.Ç. 4 | 5 | 4 | 3 | 3 | 4 | 4 | 2 | 4 | 4 | 5 |
| Ö.Ç. 5 | 5 | 4 | 4 | 4 | 5 | 4 | 4 | 5 | 4 | 5 |